差异性分析是生物医学研究中的一个重要问题。它旨在通过比较两组或多组样本数据之间的差异来识别影响复杂疾病或性状的基因、生物通路、微生物等。针对人类微生物组和水稻耐寒性的差异性分析问题,提出了自适应的分组聚合检验方法,给出了统计显著性的快速算法及其统计性质,利用多尺度分析方法有效地整合水稻耐寒性的两个性状,提出了群体分层校正方法并将其应用到水稻耐寒性的数据中,发现并验证了与水稻耐寒性相关联的基因COLD11。
[1] Wei Zhang, Aiyi Liu*, Zhiwei Zhang, Guanjie Chen, Qizhai Li*. An adaptive direction-assisted test for microbiome compositional data. Bioinformatics, 2022, 38: 3493-3500. (IF: 6.931)
附件下载: