陈翰馥院士因其在随机系统的辨识和自适应控制、随机逼近及其在系统、控制及信号处理中的应用方面的贡献，于2006年5月31日当选为IFAC Fellow。

IFAC Fellow是由国际自动控制联合会（IFAC）有关选举委员会根据相关标准严格评选出来的，主要授予在自动控制及相关领域中，以及在促进IFAC在某些领域发展中做出突出贡献的科学家。

陈翰馥于1993年当选为中科院院士，1996年当选为IEEE Fellow, 2005年当选为第三世界科学院院士，曾任国际自动控制联合会执委会委员（Council Member, 2002-2005）、中国自动化学会理事长（1993-2002）等职，现任多种国内外学术刊物的主编、编委等。