近日,国际基因组研究权威期刊《基因组学研究》(Genome Research)在线发表了由我院王勇研究员和美国斯坦福大学的科研人员合作的时间序列调控网络分析模型TimeReg。
TimeReg模型利用染色质可及性和基因表达双层短时间序列数据,识别重要调控元件和驱动转录因子,构建单样本调控网络,进而揭示网络中核心调控模块随时间的因果调控图谱,为转录调控领域的短时间序列数据分析提供了新的工具。TimeReg 方法有望推广应用于DNA、RNA,染色质和表型层面联合建模,分析高通量生物实验得到的样本匹配的发育时间序列组学数据,推断多层次分子网络来研究动物复杂性状。
《基因组学研究》是基因学最重要的学术期刊之一,是美国冷泉港实验室期刊Cold Spring Harbor Laboratory Press(CSHL)的主要期刊。冷泉港被称为世界生命科学的圣地与分子生物学的摇篮,也是国际生命科学的会议中心与培训基地。
附件下载: